Naantalin kalavedet rajoittuvat idässä Turun vesialueisiin ja lännessä Kotkan aukon ja Särkänsalmen vesillä Merimaskun ja Rymättylän vesiin.

Vanhan kaupungin länsipuolella ja Luonnonmaan saaren pohjoispuolella on vesialue, jota kutsutaan Naantalin aukoksi. Sen karikoilta ja matalikoilta löytää alkukesästä kutevat kuhat. Perhematkailuun erikoistunut kalastajaisä voi laittaa jälkikasvunsa Muumimaailmaan ja jäädä itse pilkkimään tai jiggaamaan kesäkuisia kuhia Kailon saareen vievältä sillalta.

Naantalin aukon pohjoiseen ulottuvat ruovikkoiset lahdet Rukanaukko, Oukkulanlahti, Halkkoaukko ja Suutaraukko sopivat keväiseen ja kesäiseen haukijahtiin.

Muumimaailman ja Väskin saaren välinen matalikko, Kultarannan edustan 4,5 metrinen matala ja Ladonpään edustan matala ovat assunpyytäjien suosimia pelipaikkoja niin avovesillä kuin talvipilkilläkin.

Luonnonmaan eteläpään ja Lapilan saaren ympäristön kaislikot ovat hyvää luokkaa haukivesinä.

Kotkanaukko sopii meritaimenten uisteluun, mutta alueella voi käyttää vain yhtä vapaa per kalastaja, sillä varsinaisia uistelulupia sinne ei myydä.

Metsä-Jukolan 3,7 metrin matala on myös kalastamisen arvoinen kuha- ja ahvenpaikka.